Las moscas molestan a los animales y representan una amenaza para la producción y la salud del ganado. Las principales plagas las constituyen la mosca doméstica (Musca domestica) y la mosca picadora (Stomoxys calcitrans), que se desarrollan en la mayoría de explotaciones ganaderas. Además, actúan como vectores de enfermedades, empeorando la bioseguridad de la granja.
Existen enemigos naturales que se pueden emplear como estrategia de control biológico:
Depredadores: Algunos ácaros (familias Macrochelidae, Uropodidae y Parasitidae) depredan huevos y larvas de ambos tipos de moscas. Por ejemplo, el ácaro Macrocheles muscaedomesticae es capaz de consumir más de 20 huevos de mosca al día. Algunos escarabajos, como Carcinops pumilio, son depredadores de fases larvarias de las moscas. Estados larvarios de otros organismos, como la mosca del purín (Ophyra aenescens), que se encuentra de forma natural en los establos con estiércol líquido y purín, devoran fases larvarias de la mosca doméstica. La mosca del purín no causa molestias ni al hombre ni a los animales. En algunos países se comercializan estas moscas parar emplearlas en estrategias de control biológico.
Parasitoides: Los más importantes son dos especies de avispas (Muscidifurax raptor y Spalangia endius) que se encuentran de forma natural en muchas explotaciones ganaderas. Depositan un huevo dentro de la crisálida de las moscas, de forma que la larva del parasitoide se alimenta de ésta. Al ser parásitos selectivos de las moscas, no representan un peligro ni para el hombre ni para los animales domésticos. En algunos países se comercializa Spalangia endius como herramienta de control biológico de la mosca picadora.
Patógenos: Sobre todo bacterias y hongos, destacando la bacteria con mayor efecto insecticida conocida actualmente, Bacillus thurigiensis.
Escarabajo Carcinops pumilio. Fuente: Udo Schmidt
Avispa Muscidifurax raptor. Fuente: IFAPA